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1.
Biomédica (Bogotá) ; 43(1): 121-130, mar. 2023. tab, graf
Article in English | LILACS | ID: biblio-1533912

ABSTRACT

Introduction: It has been shown that the transmission of SARS-CoV-2 occurs mainly by air, and the risk of infection is greater in closed spaces. Objective: To describe the epidemiology, virology and molecular characterization of a COVID-19 outbreak at a closed vaccination point during the third wave of SARS-CoV-2 in Colombia. Materials and methods: Diagnostic tests, interviews, sampling, cell cultures and viral sequencing were carried out, the latter being molecular characterization and lineage identification. Results: Seven workers were positive for SARS-CoV-2; among these, 3 samples were analyzed, plus an additional sample belonging to the mother of the presumed index case; all samples were identified with lineage B.1.625, with a maximum of 2 nucleotides difference between them. Conclusions: Variant B.1.625 was identified as the cause of the COVID-19 outbreak, and a co-worker was also identified as the index case. Unexpectedly, attending a vaccination day became a risk factor for acquiring the infection.


Introducción. Se ha demostrado que la transmisión de SARS-CoV-2 se produce principalmente por vía aérea y el riesgo de infección es mayor en espacios cerrados con alta concentración de personas; este último factor se presentó en algunos de los puestos de vacunación de la ciudad de Medellín. Objetivo. Describir la epidemiología, virología y caracterización molecular de un brote de COVID-19 en un punto de vacunación cerrado durante la tercera ola de SARS-CoV-2 en Colombia. Materiales y métodos. Se realizaron test diagnósticos, entrevistas, toma de muestras, aislamiento viral y secuenciación genómica. Con esta última, se hizo la caracterización molecular y se identificó el linaje. Resultados. Siete trabajadores fueron positivos para SARS-CoV-2, y de estos, tres muestras fueron secuenciadas, más una muestra adicional perteneciente a la madre del presunto caso índice. Todas las muestras fueron identificadas con el linaje B.1.625, con un máximo de dos nucleótidos de diferencia entre ellas. Conclusiones. Se identificó la variante B.1.625 como la causante del brote de COVID-19, y también un compañero de trabajo fue identificado como el caso índice. De forma imprevista, asistir a una jornada de vacunación se convirtió en un factor de riesgo para adquirir la infección.


Subject(s)
Disease Outbreaks , SARS-CoV-2 , Vaccination , Colombia , COVID-19
2.
Biomédica (Bogotá) ; 42(supl.2): 48-58, oct. 2022. tab, graf
Article in Spanish | LILACS | ID: biblio-1403612

ABSTRACT

Introducción. El síndrome respiratorio agudo grave causado por el nuevo coronavirus SARS-CoV-2 es causa de la emergencia sanitaria por la pandemia de COVID-19. Si bien el humano es el principal huésped vulnerable, en estudios experimentales y reportes de infección natural, se han encontrado casos de zoonosis inversa de SARS-CoV-2 en animales. Objetivo. Evaluar la infección natural por SARS-CoV-2 en gatos y perros de propietarios con diagnóstico de COVID-19 en el Valle de Aburrá, Antioquia, Colombia. Materiales y métodos. La circulación del SARS-CoV-2 se evaluó por RT-qPCR y RT-PCR en muestras de frotis nasofaríngeos y orofaríngeos de gatos y perros cuyos propietarios se encontraban dentro del periodo de los 14 días de aislamiento. Los casos positivos se verificaron amplificando fragmentos de los genes RdRp, N y E; se secuenció el gen RdRp y se analizó filogenéticamente. Resultados. De 80 animales evaluados, seis gatos y tres perros fueron casos confirmados de infección natural por SARS-CoV-2. Los animales no presentaron signos clínicos y sus propietarios, que padecían la infección, reportaron únicamente signos leves de la enfermedad sin complicaciones clínicas. En el análisis de una de las secuencias, se encontró un polimorfismo de un solo nucleótido (SNP) con un cambio en la posición 647, con sustitución del aminoácido serina (S) por una isoleucina (I). Los casos se presentaron en los municipios de Caldas, Medellín y Envigado. Conclusiones. Se infiere que la infección natural en los gatos y perros se asocia al contacto directo con un paciente con COVID-19. No obstante, no es posible determinar la virulencia del virus en este huésped, ni su capacidad de transmisión zoonótica o entre especie.


Introduction: The severe acute respiratory syndrome caused by the new coronavirus SARS-CoV-2 is the cause of the health emergency due to the COVID-19 pandemic. Although humans are the main susceptible host, experimental studies and reported cases of natural infection have evidenced scenarios of SARS-CoV-2 reverse zoonosis in animals. Objective: To evaluate the natural infection of SARS-CoV-2 in cats and dogs with owners diagnosed with COVID-19 in the Valle de Aburrá subregion in Antioquia, Colombia. Materials and methods. The circulation of SARS-CoV-2 was evaluated by RT-qPCR and RT-PCR in samples of nasopharyngeal and oropharyngeal smears from cats and dogs whose owners presented latent COVID-19 infection. Positive cases were verified through amplification of N, E and RdRp gene fragments; with the latter being sequenced and the phylogenetically analyzed. Results. From 80 tested animals, 6 cats and 3 dogs resulted positive for natural SARS-CoV-2 infection. These animals did not show any clinical signs; and their infected owners only reported mild signs of COVID-19, without clinical complications. Regarding analysis of one of the sequences, a single nucleotide polymorphism (SNP) was found, with a substitution in position 647, resulting in the change of the amino acid serine (S) for isoleucine (I). The cases occurred in the municipalities of Caldas, Medellín and Envigado. Conclusions. It is inferred that natural infection in cats and dogs is associated with direct contact with a positive COVID-19 patient.


Subject(s)
Zoonoses , Coronavirus Infections , Phylogeny , Severe Acute Respiratory Syndrome , Host Microbial Interactions
3.
Biomédica (Bogotá) ; 41(supl.2): 86-102, oct. 2021. graf
Article in English | LILACS | ID: biblio-1355762

ABSTRACT

Abstract | Introduction: Immunological markers have been described during COVID-19 and persist after recovery. These immune markers are associated with clinical features among SARS- CoV-2 infected individuals. Nevertheless, studies reporting a comprehensive analysis of the immune changes occurring during SARS-CoV-2 infection are still limited. Objective: To evaluate the production of proinflammatory cytokines, the antibody response, and the phenotype and function of NK cells and T cells in a Colombian family cluster with SARS-CoV-2 infection. Materials and methods: Proinflammatory cytokines were evaluated by RT-PCR and ELISA. The frequency, phenotype, and function of NK cells (cocultures with K562 cells) and T-cells (stimulated with spike/RdRp peptides) were assessed by flow cytometry. Anti-SARS-CoV-2 antibodies were determined using indirect immunofluorescence and plaque reduction neutralization assay. Results: During COVID-19, we observed a high proinflammatory-cytokine production and a reduced CD56bright-NK cell and cytotoxic response. Compared with healthy controls, infected individuals had a higher frequency of dysfunctional CD8+ T cells CD38+HLA-DR-. During the acute phase, CD8+ T cells stimulated with viral peptides exhibited a monofunctional response characterized by high IL-10 production. However, during recovery, we observed a bifunctional response characterized by the co-expression of CD107a and granzyme B or perforin. Conclusion: Although the proinflammatory response is a hallmark of SARS-CoV-2 infection, other phenotypic and functional alterations in NK cells and CD8+ T cells could be associated with the outcome of COVID-19. However, additional studies are required to understand these alterations and to guide future immunotherapy strategies.


Resumen | Introducción. Se han descrito diferentes marcadores inmunológicos durante la COVID-19, los cuales persisten incluso después de la convalecencia y se asocian con los estadios clínicos de la infección. Sin embargo, aún son pocos los estudios orientados al análisis exhaustivo de las alteraciones del sistema inmunológico en el curso de la infección. Objetivo. Evaluar la producción de citocinas proinflamatorias, la reacción de anticuerpos, y el fenotipo y la función de las células NK y los linfocitos T en una familia colombiana con infección por SARS-CoV-2. Materiales y métodos. Se evaluaron las citocinas proinflamatorias mediante RT-PCR y ELISA; la frecuencia, el fenotipo y la función de las células NK (en cocultivos con células K562) y linfocitos T CD8+ (estimulados con péptidos spike/RdRp) mediante citometría de flujo, y los anticuerpos anti-SARS-CoV-2, mediante inmunofluorescencia indirecta y prueba de neutralización por reducción de placa. Resultados. Durante la COVID-19 hubo una producción elevada de citocinas proinflamatorias, con disminución de las células NK CD56 bright y reacción citotóxica. Comparados con los controles sanos, los individuos infectados presentaron con gran frecuencia linfocitos T CD8+ disfuncionales CD38+HLA-DR-. Además, en los linfocitos T CD8+ estimulados con péptidos virales, predominó una reacción monofuncional con gran producción de IL-10 durante la fase aguda y una reacción bifuncional caracterizada por la coexpresión de CD107a y granzima B o perforina durante la convalecencia. Conclusión. Aunque la reacción inflamatoria caracteriza la infección por SARS-CoV-2, hay otras alteraciones fenotípicas y funcionales en células NK y linfocitos T CD8+ que podrían asociarse con la progresión de la infección. Se requieren estudios adicionales para entender estas alteraciones y guiar futuras estrategias de inmunoterapia.


Subject(s)
Coronavirus Infections , Killer Cells, Natural , T-Lymphocytes , Antibodies, Neutralizing , Inflammation
4.
Biomédica (Bogotá) ; 40(supl.2): 148-158, oct. 2020. graf
Article in Spanish | LILACS | ID: biblio-1142458

ABSTRACT

Introducción. El nuevo coronavirus causante de un brote de enfermedad respiratoria aguda en China en diciembre de 2019 se identificó como SARS-CoV-2. La enfermedad, denominada COVID-19, fue declarada pandemia por la Organización Mundial de la Salud (OMS). El primer caso de COVID-19 en Colombia se reportó el 6 de marzo de 2020; en este estudio se caracterizó un aislamiento temprano del virus SARS-CoV-2 de una muestra recolectada en abril de 2020. Objetivos. Describir y caracterizar una cepa temprana a partir de un aislamiento de SARS-CoV-2 durante la pandemia en Colombia. Materiales y métodos. Se obtuvo una muestra de un paciente con COVID-19 confirmada por qRT-PCR; la muestra fue inoculada en diferentes líneas celulares hasta la aparición del efecto citopático. Para confirmar la presencia de SARS-CoV-2 en el cultivo, se utilizó la qRT-PCR a partir de los sobrenadantes, la inmunofluorescencia indirecta (IFI) en células Vero-E6, así como microscopía electrónica y secuenciación de nueva generación (next-generation sequencing). Resultados. Se confirmó el aislamiento de SARS-CoV-2 en células Vero-E6 por la aparición del efecto citopático tres días después de la infección, así como mediante la qRT-PCR y la IFI positiva con suero de paciente convaleciente positivo para SARS-CoV-2. Además, en las imágenes de microscopía electrónica de trasmisión y de barrido de células infectadas se observaron estructuras compatibles con viriones de SARS-CoV-2. Por último, se obtuvo la secuencia completa del genoma, lo que permitió clasificar el aislamiento como linaje B.1.5. Conclusiones. La evidencia presentada en este artículo permite confirmar el primer aislamiento de SARS-CoV-2 en Colombia. Además, muestra que esta cepa se comporta en cultivo celular de manera similar a lo reportado en la literatura para otros aislamientos y que su composición genética está acorde con la variante predominante en el mundo. Finalmente, se resalta la importancia que tiene el aislamiento viral para la detección de anticuerpos, para la caracterización genotípica y fenotípica de la cepa y para probar compuestos con potencial antiviral.


Introduction: SARS-CoV-2 has been identified as the new coronavirus causing an outbreak of acute respiratory disease in China in December, 2019. This disease, currently named COVID-19, has been declared as a pandemic by the World Health Organization (WHO). The first case of COVID-19 in Colombia was reported on March 6, 2020. Here we characterize an early SARS-CoV-2 isolate from the pandemic recovered in April, 2020. Objective: To describe the isolation and characterization of an early SARS-CoV-2 isolate from the epidemic in Colombia. Materials and methods: A nasopharyngeal specimen from a COVID-19 positive patient was inoculated on different cell lines. To confirm the presence of SARS-CoV-2 on cultures we used qRT-PCR, indirect immunofluorescence assay, transmission and scanning electron microscopy, and next-generation sequencing. Results: We determined the isolation of SARS-CoV-2 in Vero-E6 cells by the appearance of the cytopathic effect three days post-infection and confirmed it by the positive results in the qRT-PCR and the immunofluorescence with convalescent serum. Transmission and scanning electron microscopy images obtained from infected cells showed the presence of structures compatible with SARS-CoV-2. Finally, a complete genome sequence obtained by next-generation sequencing allowed classifying the isolate as B.1.5 lineage. Conclusion: The evidence presented in this article confirms the first isolation of SARS-CoV-2 in Colombia. In addition, it shows that this strain behaves in cell culture in a similar way to that reported in the literature for other isolates and that its genetic composition is consistent with the predominant variant in the world. Finally, points out the importance of viral isolation for the detection of neutralizing antibodies, for the genotypic and phenotypic characterization of the strain and for testing compounds with antiviral potential.


Subject(s)
Coronavirus Infections , Microscopy, Electron , Fluorescent Antibody Technique, Indirect , Severe Acute Respiratory Syndrome , Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus , High-Throughput Nucleotide Sequencing
5.
Infectio ; 23(supl.1): 97-105, dic. 2019. tab, graf
Article in Spanish | LILACS, COLNAL | ID: biblio-984513

ABSTRACT

Objetivo: Estimar las frecuencias de mutaciones y de polimorfismos adicionales asociados con resistencia a los fármacos inhibidores de la integrasa del virus de inmunodeficiencia humana tipo 1 (VIH-1). Metodología: Estudio descriptivo, de corte transversal, en individuos VIH-1 positivos de la ciudad de Medellín, quienes no habían recibido tratamiento antirretroviral. En ellos se determinó, a través del método de 2-dideoxinucleótidos y el sistema ABI3730XL, la secuencia del gen de la integrasa del VIH-1 a partir del ARN viral circulante, la cual fue analizada en la base de datos de resistencia a medicamentos antirretrovirales de la Universidad de Stanford y según reportes de literatura científica. Resultados: Se encontraron las siguientes mutaciones (con sus respectivas frecuencias): una mutación mayor, E138K (1/46), tres mutaciones accesorias G163E (3/46), L74I (3/50) y E157Q (2/48), una mutación no polimórfica A128T (1/49) y otras dos mutaciones potencialmente asociadas con resistencia a inhibidores de integrasa S230N (9/39) y S119P/R/T (4/47, 2/47 y 14/47, respectivamente). Conclusiones: En las secuencias analizadas, llama la atención la presencia de al menos una mutación asociada a resistencia a inhibidores de integrasa en el 14% de los individuos estudiados, sugiriendo una pobre presión selectiva de este tipo de fármacos en la población viral circulante en la zona.


Aim: To estimate the frequencies of major and accessory mutations, as well as additional polymorphisms associated with resistance to human immunodeficiency virus type 1 (VIH-1) integrase strand transfer inhibitors. Materials and methods: Descriptive cross-sectional study, focused on HIV-1 positive individuals from Medellín, recruited between 2013 and 2015, and that had not received antiretroviral therapy. In these patients, the sequence from HIV-1 integrase was determined from circulating viral RNA through Sanger chain termination method with the ABI3730XL system, and the sequences were analyzed using the HIV Drug Resistance Database from the University of Stanford, together with previous literature reports. Results: The following mutations associated with resistance to integrase strand transfer inhibitors, along with its respective frequencies, were found: one major mutation, E138K (1/46), three accessory mutations, G163E (3/46), L74I (3/50) and E157Q (2/48); one non-polymorphic mutation, A128T (1/49); and two mutations potentially associated with resistance to integrase strand transfer inhibitors, S230N (9/39) and S119P/R/T (4/47, 2/47 and 14/47, respectively). Conclusions: In the sequences analyzed, it is noteworthy the presence of at least one mutation related with resistance to integrase inhibitors in 14% of the studied patients, suggesting a poor selective pressure of this kind of drugs in the circulating viral population in our region.


Subject(s)
Humans , Male , Female , Adult , Drug Resistance , HIV-1 , Integrase Inhibitors , Mutation , RNA, Viral , Pharmaceutical Preparations , HIV , Colombia , Anti-Retroviral Agents , Dideoxynucleotides , Herpes Zoster
6.
Ter. psicol ; 37(2): 154-165, ago. 2019. tab
Article in Spanish | LILACS | ID: biblio-1059114

ABSTRACT

Resumen La violencia entre parejas de adolescentes es un tema de relevancia a nivel social, destacando por sus tasas de prevalencia y graves consecuencias. Como objetivo, se plantea comprobar los niveles de prevalencia de sucesos violentos en parejas adolescentes y jóvenes, y determinar los niveles de concordancia en la ocurrencia de la violencia en base a la información aportada por ambos miembros de la pareja. La muestra se conforma de 106 parejas con un rango de edad entre 18 y 30 años. Se aplicó de forma independiente el cuestionario de violencia entre novios, versión para parejas (CUVINO-VA). Los resultados reflejaron una alta prevalencia de violencia en sus relaciones de noviazgo y elevadas discrepancias en su percepción, estadísticamente significativas, tanto en varones como mujeres tanto en los roles de agresión como de victimización.


Abstract Violence between adolescent couples is a topic of social relevance, highlighted by its prevalence rates and its serious consequences. As an objective, it is proposed to check the levels of prevalence of violent events in adolescent and young couples and to determine the levels of concordance in the occurrence of violence during courtship based on the information provided by both members of the same couple. The sample consists of 106 couples with an age range between 18 and 30 years, to who was applied independently the questionnaire of violence between dating, in its version for couples (CUVINO-VA). The results reflected a high prevalence of violence in their dating relationships and high discrepancies in their perception, statistically significant, in both men and women in both the roles of aggression and victimization.


Subject(s)
Humans , Male , Female , Adolescent , Adult , Young Adult , Violence/psychology , Sexual Partners/psychology , Aggression/psychology , Interpersonal Relations , Perception , Surveys and Questionnaires , Violence Against Women
7.
rev. udca actual. divulg. cient ; 21(1): 119-126, ene.-jun. 2018. tab, graf
Article in English | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1094712

ABSTRACT

SUMMARY Bovine leukemia virus (BLV) is an immunosuppressant retrovirus that primarily affects dairy livestock, its target cells are B lymphocytes in which it integrates its genome infecting cattle for life. It is important to identify the distribution of the BLV in the region and to reconstruct its evolutionary history through phylogenetic trees, for the province of Antioquia this is the first report of the BLV genotypes. The aim of this study was to identify the genotype of BLV circulating in dairy cattle of different regions of the province of Antioquia, Colombia. DNA was extracted from 8 Holstein cows. Nested PCR was performed to amplify a fragment of 444 pb of the env gene. The env viral gene codes for surface protein gp51, gene is highly conserved and it is used for phylogenetic analysis. Obtained amplicons were sequenced, manually aligned in MEGA V7 program, and compared to 53 viral env gene sequences registered in GenBank. Phylogenetic analysis was performed by Maximum Likelihood and Bayesian methods. Two circulating genotypes were found: the most common genotype was 1, found in seven samples; they grouped with sequences from EE. UU, Argentina and Japan; only one sample was classified as genotype 3 and was grouped with samples from EE. UU and Japan. At least two genotypes (1 and 3) of BLV are circulating in Antioquia; however, more cattle and herds should be evaluated to elucidate the diversity and distribution of BLV in Colombia.


RESUMEN El virus de la leucosis bovina (BLV) es un retrovirus inmuno-supresor que afecta, principalmente, al ganado lechero; sus células diana son los linfocitos B, en los cuales, integra su genoma, infectando al ganado de por vida. Es importante identificar la distribución del BLV en la región y reconstruir su historia evolutiva, a través de árboles filogenéticos; para el departamento de Antioquia, este es el primer reporte de los genotipos del BLV. El objetivo de este estudio fue identificar el genotipo de BLV que circula en ganado lechero de diferentes regiones del departamento de Antioquia, Colombia. Se extrajo ADN de 8 vacas Holstein. Se realizó una PCR anidada, para amplificar un fragmento del gen env de 444 pb. El gen env viral codifica la proteína de superficie gp51, altamente conservado y es usado en análisis filogenéticos. Los amplicones obtenidos se secuenciaron, se alinearon manualmente en el programa MEGA V7 y se compararon con 53 secuencias del gen env viral, registradas en GenBank. El análisis filogenético, se realizó por métodos de Máxima Verosimilitud y Bayesianos. Se encontraron dos genotipos circulantes: el genotipo más común fue 1, hallado en siete muestras, agrupadas con secuencias de EE. UU, Argentina y Japón; solo una muestra se clasificó como genotipo 3 y se agrupó con muestras de EE. UU y Japón. Al menos dos genotipos (1 y 3) de BLV están circulando en Antioquia; sin embargo, se deben evaluar más bovinos y hatos para elucidar la diversidad y la distribución de BLV en Colombia.

8.
Iatreia ; 31(1): 36-50, ene.-mar. 2018. tab, graf
Article in Spanish | LILACS | ID: biblio-892686

ABSTRACT

RESUMEN Los virus transmitidos por garrapatas (VTG) pertenecen a las familias Flaviviridae, Bunyaviridae, Reoviridae, Asfarviridae y Orthomyxoviridae y son agentes causales de diferentes enfermedades en humanos y animales. Debido a la creciente importancia epidemiológica que están teniendo los VTG, esta revisión pretende englobar el conocimiento actual de estos agentes y las enfermedades que producen, así como exponer las estrategias abordadas en prevención y tratamiento que se han implementado hasta el momento en diferentes países. Es evidente que para la región Neotropical hacen falta estudios sobre los VTG presentes en la región, ya que la gran mayoría de los artículos, tanto revisiones de tema como trabajos originales, presentan datos de las regiones Neártica y Paleártica. Considerando el panorama actual de los estudios de VTG en la región Neotropical y las particularidades de la misma, es muy probable que existan otros VTG aún no identificados que podrían tener algún impacto en salud pública.


SUMMARY Tick-borne viruses (TBVs) belong to the Flaviviridae, Bunyaviridae, Reoviridae, Asfarviridae and Orthomyxoviridae families and cause different diseases in humans and animals. Due to the epidemiologic relevance of TBVs, this review highlights the actual knowledge of these agents and the diseases they cause, besides of the prevention and treatment strategies implemented so far. It is evident that studies that address the TBVs present in the Neotropical region are missing, since most of the studies, both reviews and original articles, present data from the Nearctic and Palearctic regions. Considering the current picture of the TBVs studies in the Neotropical area and its peculiarities, is probable that other not yet identified TBVs exist in this zone and have an impact in public health.


Subject(s)
Humans , Ticks , Virus Diseases , Public Health
9.
Biomédica (Bogotá) ; 37(supl.1): 75-85, abr. 2017. tab, graf
Article in Spanish | LILACS | ID: biblio-888513

ABSTRACT

Resumen Introducción. El virus de la coriomeningitis linfocítica es un arenavirus del Viejo Mundo que se hospeda en el ratón casero (Mus musculus), y puede causar infecciones congénitas, hidrocefalia, coriorretinitis y falla orgánica múltiple en pacientes receptores de trasplantes. En Colombia aún no se ha reportado la enfermedad mediante diagnóstico clínico, pero en estudios serológicos se ha detectado la infección por el virus Pichindé en roedores en los departamentos del Cauca y Valle del Cauca, y por el virus Guanarito, en roedores en Córdoba. Objetivo. Detectar el virus de la coriomeningitis linfocítica en M. musculus en el municipio de Sincelejo. Materiales y métodos. Se evaluaron 80 muestras de plasma mediante la prueba ELISA usando antígeno del virus de la coriomeningitis linfocítica. Además, se empleó la reacción en cadena de la polimerasa con transcriptasa inversa (RT-PCR) anidada en muestras de animales seropositivos y seronegativos para la detección del segmento S. Resultados. Se encontró una seroprevalencia de 10% (8/80) y se detectó el genoma viral en 16 muestras de cerebro; el alineamiento (en la Basic Local Alignment Search Tool, BLAST) y el análisis filogenético (mediante el programa MrBayes, versión 3.2.2) confirmaron que correspondía al virus de la coriomeningitis linfocítica. Conclusión. Los resultados indicaron que la infección por el virus de la coriomeningitis linfocítica en humanos podría ocurrir en el área urbana de Sincelejo, aunque hasta la fecha no se hayan reportado casos.


Abstract Introduction: The lymphocytic choriomeningitis virus is an Old World arenavirus that infects Mus musculus, and can cause congenital hydrocephalus, chorioretinitis and multisystemic failure in transplant human recipients. Although the disease has not been clinically diagnosed in Colombia yet, there have been reports of infection with the Pichindé virus in rodents from Cauca and Valle del Cauca departments, and with the Guanarito virus in rodents from Córdoba department. Objective: To identify the lymphocytic choriomeningitis virus from Mus musculus captured in the municipality of Sincelejo. Materials and methods: We evaluated 80 samples of plasma by ELISA using antigen from lymphocytic choriomeningitis virus. Additionally, a nested RT-PCR was performed to seropositive and seronegative samples for the S-segment. Results: We found a 10% seroprevalence (8/80) and the viral genome was detected in 16 brain samples; the alignment (BLAST) and the phylogenetic analysis (MrBayes, version 3.2.2) confirmed the presence of the lymphocytic choriomeningitis virus. Conclusion: The results indicated that human infection with the lymphocytic choriomeningitis virus in humans could occur in the urban area of Sincelejo, although no cases have been reported so far.


Subject(s)
Animals , Humans , Mice , Rodentia/virology , Enzyme-Linked Immunosorbent Assay/methods , Arenaviridae Infections/virology , Lymphocytic choriomeningitis virus/immunology , Antibodies, Viral/blood , Phylogeny , Brain , Seroepidemiologic Studies , Colombia/epidemiology , Lymphocytic choriomeningitis virus/chemistry , Antibodies, Viral/analysis
10.
Rev. latinoam. psicol ; 49(1): 36-47, ene.-abr. 2017. tab
Article in Spanish | LILACS, COLNAL | ID: biblio-901969

ABSTRACT

Resumen La mayoría de la literatura sobre la psicopatía gira en torno a su medida. Cuatro son los instrumentos y familias de referencia en la evaluación de la psicopatía: la Psychopathy Checklist (PCL), la Levenson's Primary and Secondary Psychopathy Scales (LPSP), la Self-Report Psychopathy Scale (SRP), y el Psychopathic Personality Inventory (PPI). Ante este estado de la cuestión, nos planteamos llevar a cabo un metaanálisis psicométrico correlacional con el cual someter a prueba la validez convergente de estos instrumentos a nivel unidimensional y en los dos factores comunes a todos ellos: el factor afectivo y el factor antisocial. Los resultados mostraron una validez convergente positiva, significativa y generalizable entre los instrumentos, tanto en la dimensión psicopatía como en los factores afectivo y antisocial. Asimismo, los resultados pusieron de manifiesto que la PCL es el instrumento más idóneo para la evaluación de la psicopatía en poblaciones clínicas y el PPI en población subclínica.


Abstract Most of the literature on psychopathy is focused on its measurement. There are four reference tools used to assess psychopathy: the Psychopathy Checklist (PCL), the Levenson's Primary and Secondary Psychopathy Scales (LPSP), the Self-Report Psychopathy Scale (SRP), and the Psychopathic Personality Inventory (PPI). In order to do this, a psychometric correlational meta-analysis was designed to test the convergent validity between these tools on the psychopathy dimension and the two common factors among them: the affective and antisocial deviation factors. The results showed a positive, significant and generalisable convergent validity between tools, in the psychopathy dimension, as well as in the affective and antisocial factors. Moreover, the results also showed that the PCL was the most appropriate tool to measure psychopathy in clinical samples, and the PPI was so in sub-clinical cases.


Subject(s)
Meta-Analysis , Evaluation Study , Psychometrics , Antisocial Personality Disorder
11.
Article in English | IMSEAR | ID: sea-177581

ABSTRACT

Introduction: We conducted a retrospective study at the Wayne County Medical Examiner Office, which examined decedents diagnosed with Fibromyalgia, a disorder of unknown etiology characterized by widespread chronic musculoskeletal pain, concomitant with fatigue, sleep disturbances, and psychological distress. Material & Methods: Over a seventeen year period a total of 54 cases from our database met this criterion. Other criteria in the study included cause and manner of death, post-mortem toxicology results, major autopsy findings, and medical history. Results: Our study revealed that the cause of death in approximately two-thirds of the cases was due to drug intoxication. The most frequent post-mortem toxicology finding was Opioids, such as Morphine, Hydrocodone, Oxycodone, Fentanyl, and Codeine. The most common manner of death was accident. Almost 90% of the decedents were Caucasian females, which contrasted with the demographic diversity of Wayne County, Michigan. Additional findings revealed that the average age was 47 years, and the average Body Mass Index (BMI) could be categorized as obese. Nearly 67% of the cases had a medical history of depression. Conclusion: Our findings suggest that Fibromyalgia might be a psychosomatic symptom of depression rather than comorbidity. Therefore, physicians should further inquire about, and consider treating, depression in patients with chronic musculoskeletal pain while completely avoiding the use of opioids, for opioids have a greater risk of being abused and resulting in death in such patients, as found in our study.

12.
Vitae (Medellín) ; 21(2): 114-125, 2014. Ilus
Article in English | LILACS, COLNAL | ID: biblio-987148

ABSTRACT

Background: Human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) infection and Acquired immunodeficiency syndrome are mayor global public health issues. HIV-1 infection is now manageable as a chronic disease thanks to the development of antiretroviral therapy; however, the existence of HIV drug resistance and collateral effects have increased the search for therapeutic alternatives. Compounds of marine resources have been studied for their antiviral potential. Objectives: To evaluate the antiviral activity of isolated bromotyrosine-derivative compounds from the Colombian marine sponges, Verongula rigida and Aiolochoria crassa against HIV-1 infection in vitro. Methods: Cytotoxicity of 11 bromotyrosine-derivative compounds was determined by the MTT assay. Inhibition of HIV-1 replication was performed using the U373-MAGI cell line, which was infected with recombinant green fluorescent protein (GFP)-expressing viruses pseudotyped, in the presence or absence of the compounds. The percentage of infected cells was evaluated by flow cytometry. In addition, the inhibition of reverse transcription and nuclear import was determined by quantification of early and late reverse transcription products and 2-LTR circles, respectively, using quantitative PCR. Results: Aeroplysinin-1, purealidin B and 3-bromo-5-hydroxy-Omethyltyrosine inhibited the HIV-1 replication in a dose-dependent manner, with a median maximum percentage of inhibition of 74% (20 µM), 57% (80 µM) and 47% (80 µM), respectively. Importantly, none of these concentrations were cytotoxic. Aeroplysinin-1, 19-deoxyfistularin 3, purealidin B, fistularin 3 and 3-bromo-5-hydroxy-O-methyltyrosine inhibited the nuclear import efficiently; while 3,5-dibromoN,N,N,O-tetramethyltyraminium, aeroplysinin-1, purealidin B, fistularin 3 and 3-bromo-5-hydroxy-Omethyltyrosine inhibited X4 HIV-1 cell entry with a median maximum percentage of inhibition ranging between 2 to 30%. Conclusions: Aeroplysinin-1, 19-deoxyfistularin 3, purealidin B, fistularin 3 and 3-bromo-5-hydroxy-O-methyltyrosine inhibited HIV replication at different steps. This study opens the possibility of chemically synthesizing these compounds and evaluating them as alternative therapies against HIV-1.


Subject(s)
Humans , HIV , Porifera , Marine Resources , Immunologic Deficiency Syndromes
13.
Rev. saúde pública ; 47(6): 1080-1091, dez. 2013. tab, graf
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-702727

ABSTRACT

OBJETIVO : Estimar la seroprevalencia de rubéola y factores asociados. METODOS : Estudio de seroprevalencia poblacional con una muestra aleatoria de 2.124 individuos de seis a 64 años, representativa por edad, sexo y área en Medellín, Colombia, 2009. Se analizó la asociación de variables biológicas y socioeconómicas con la seroprotección para rubéola, según la cohorte del año de nacimiento antes (1954 a 1990) y después (1991 a 2003) del inicio de la vacunación universal. Se determinaron los títulos de IgG con pruebas de alta sensibilidad (AxSYM ® Rubella IgG – Laboratorio Abbott) y especificidad (VIDAS RUB IgG II ® – Laboratorio BioMerieux). Se estimaron proporciones y promedios ponderados derivados de un muestreo complejo incluyendo un factor de corrección por las diferencias en la participación por sexo. Se analizó la asociación de la protección por grupos de variables biológicas y sociales con un modelo de regresión logística, según la cohorte de nacimiento. RESULTADOS : Los títulos promedio de IgG fueron más altos en los nacidos antes del inicio de la vacunación (media 110 UI/ml; IC95% 100,5;120,2) que en los nacidos después (media 64 UI/ml; IC95% 54,4;72,8), p = 0,000. La proporción de protección fue creciente de 88,9% en los nacidos en 1990-1994, de 89,2% en 1995-1999 y de 92,1% en 2000 a 2003, posiblemente relacionado con la administración del refuerzo desde 1998. En los nacidos antes del inicio de la vacunación, la seroprotección estuvo asociada con el antecedente de contacto con casos (RD 2,6; IC95% 1,1;5,9), el estado de salud (RD 2,5; IC95% 1,05;6,0), el nivel de escolaridad (RD 0,2; IC95% 0,08;0,8) y los años de residencia del hogar en el barrio (RD 0,96; IC95% 0,98;1,0), luego de ajustar por todas las variables. En los nacidos después ...


OBJETIVO : Estimar a soroprevalência de rubéola e fatores associados. MÉTODOS : Estudo de soroprevalência em população a través de uma amostra aleatória de 2.124 indivíduos de seis a 64 anos, representativa por idade, sexo e área em Medellín, Colômbia, 2009. Foi analisada a associação de variáveis biológicas e socioeconômicas com a soroproteção para rubéola, de acordo com a coorte de nascimento antes (1954 a 1990) e depois (1991 a 2003) do inicio da vacinação universal. Foram determinados os títulos de IgG com testes de alta sensibilidade (AxSYM® Rubella IgG – Laboratório Abbott) e especificidade (VIDAS RUB IgG II® – Laboratório BioMerieux). Foram estimadas proporções e médias ponderadas derivadas de amostragem complexa incluindo um fator de correição pelas diferenças na participação por sexo. Foi analisada a associação da proteção por grupos de variáveis biológicas e sociais com um modelo de regressão logística, segundo a coorte de nascimento. RESULTADOS : As médias dos títulos de IgG foram maiores nos nascidos antes do inicio da vacinação (média 110UI/ml; IC95% 100,5;120,2) do que nos nascidos posteriormente (média 64 UI/ml; IC 95% 54,4;72,8), p = 0,000. A proporção de proteção foi crescente de 88,9% nos nascidos em 1990-1994, de 89,2% em 1995-1999 e de 92,1% em 2000 a 2003, provavelmente relacionado à administração do reforço desde 1998. A soroproteção esteve associada nos nascidos antes com o fato de ter contato com casos (RD 2,6; IC95% 1,1;5,9), o estado de saúde (RD 2,5; IC95% 1,05;6,0), o nível de escolaridade (RD 0,2; IC95% 0,08;0,8) e os anos morando no bairro (RD 0,96; IC95% 0,98;1,0), após ajuste por todas ...


OBJECTIVE : To estimate the seroprevalence of rubella and associated factors. METHODS : Population-based seroprevalence study in a random sample of 2,124 individuals, aged six to 64 years, representative by age, sex and area in Medellín, Colombia, 2009. Biological and socioeconomic variables were analyzed for their association with serum protection against rubella, according to birth-year cohort; those born before (1954-1990) and after (1991-2003) the introduction of universal immunization. Titer of IgG antibodies against the rubella virus was detected using a high sensitivity (AxSYM®Rubella IgG – Abbott Laboratories) and a high specificity test (VIDAS RUB IgG II®– BioMerieux Laboratories). Proportions and weighted averages derived from a complex sample, including a correction factor for differences in gender participation, were estimated. Association with protection for groups of biological and social variables according to birth cohort was analyzed using a logistic regression model. RESULTS : Titers of IgG antibodies were higher in those born before (mean 110 UI/ml, 95%CI 100.5;120.2) compared to those born after (mean 64 UI/ml; 95%CI 54.4;72.8; p = 0.000) the introduction of mass immunization. The proportion of protection increased from 88.9% in those born 1990-1994, to 89.2% in those born 1995-1999 and to 92.1% in those born between 2000 and 2003, possibly due to boosters being administered from 1998 onwards. In those born before the introduction of the immunization, seroprotection was associated with previous contact with cases (OR 2.6; 95%CI 1.1;5.9), self- perceived health status (OR 2.5; 95%CI 1.05;6.0), educational level (OR 0.2; 95%CI 0.08;0.8) and years of residence in the neighborhood (RD 0,96; 95%CI 0.98;1.0) after adjusting for all variables. In those born after, serum protection was associated with effective sleep time (OR 1,4; 95%CI 1.09;1.8) and self-perceived health status (OR 5.5; 95%CI ...


Subject(s)
Adolescent , Adult , Child , Female , Humans , Male , Middle Aged , Young Adult , Antibodies, Viral/blood , Immunoglobulin G/blood , Rubella virus/immunology , Rubella/epidemiology , Cohort Studies , Colombia/epidemiology , Mass Vaccination , Measles-Mumps-Rubella Vaccine/administration & dosage , Measles-Mumps-Rubella Vaccine/immunology , Risk Factors , Rubella/diagnosis , Seroepidemiologic Studies
14.
Biomédica (Bogotá) ; 33(supl.1): 38-51, set. 2013. ilus, graf, tab
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-695795

ABSTRACT

Introducción. Las rickettsias son bacterias patógenas usualmente transmitidas por ectoparásitos, como garrapatas, piojos o pulgas. En la última década se presentaron tres brotes de rickettsiosis con casos fatales en la región noroccidental de Antioquia y en un municipio limítrofe de Córdoba. Objetivo. Describir la ecología y la epidemiología de las infecciones por Rickettsia spp. en el Urabá antioqueño. Materiales y métodos. Se obtuvieron muestras de 354 roedores y se recolectaron 839 ectoparásitos de estos en los municipios de Apartadó, Turbo y Necoclí. Asimismo, se obtuvieron 220 sueros humanos. Estas muestras fueron estudiadas por reacción en cadena de la polimerasa (PCR) e inmunofluorescencia indirecta (IFI) para la detección de infección por rickettsias. Resultados. Por IFI se detectaron anticuerpos antirickettsias en 130 (43 %) de los roedores y en 53 (24 %) de los sueros humanos estudiados. Además, se amplificaron secuencias del gen gltA específicas del género Rickettsia en 23 (6,8 %) muestras de hígado de roedores, las cuales mostraron una similitud del 98,7 % con R. prowazekii . Una secuencia de gltA obtenida de larvas de garrapatas del género Amblyomma sp., tuvo una identidad mayor de 99 % con las secuencias de R. tamurae . Conclusión. Estos resultados demuestran la circulación de rickettsias en roedores, ectoparásitos y humanos en los municipios estudiados.


Introduction: Rickettsia spp. are tick, flea or lice-borne pathogenic bacterium, usually carried by rodents. In the last decade three outbreaks of rickettsial disease including fatalities, occurred in the provinces of Antioquia and Córdoba in northwestern Colombia. Objective: The purpose of this study was to perform an ecological and epidemiological description of the Rickettsia spp infection in the recently affected region of Colombia. Materials and methods: Samples were obtained from 354 rodents and their parasites captured in the municipalities of Apartadó, Turbo and Necoclí. Likewise, 220 human sera were also collected, for detection of infection by Rickettsia spp. Results: Indirect immunofluorescence assay (IFA) revealed that 130 (43%) of the rodents and 53 (24%) of the humans produced antibodies to Rickettsia spp. Additionally, rickettsial DNA was amplified by PCR from 23 (6.8%) rodent liver samples using primers directed to the genus specific gltA gene. While gltA sequences from rodent samples exhibited a 98.7% similitude with R . prowazekii, a sequence amplified from larvae of Amblyomma sp exhibited identities of >99% similarity with R. tamurae . Conclusion: These results demonstrate the presence of rickettsia in rodents, ectoparasites and humans throughout the municipalities studied.


Subject(s)
Adult , Animals , Child , Female , Humans , Male , Middle Aged , Antibodies, Bacterial/blood , Arachnid Vectors/microbiology , Disease Reservoirs/parasitology , Rickettsia Infections/epidemiology , Rickettsia/isolation & purification , Rodentia/parasitology , Tick Infestations/veterinary , Colombia/epidemiology , Disease Outbreaks , Endemic Diseases , Immunoglobulin G/blood , Immunoglobulin G/immunology , Larva/microbiology , Liver/microbiology , Mites/microbiology , Phylogeny , Rickettsia Infections/blood , Rickettsia Infections/transmission , Rickettsia Infections/veterinary , Rickettsia/genetics , Rickettsia/immunology , Rodentia/blood , Seroepidemiologic Studies , Socioeconomic Factors , Tick Infestations/epidemiology , Ticks/microbiology
15.
Biomédica (Bogotá) ; 33(supl.1): 99-107, set. 2013. tab
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-695801

ABSTRACT

Introducción. La región de Urabá es endémica para varias enfermedades febriles agudas de origen infeccioso. Sin embargo, solo los pacientes con malaria pueden acceder a un diagnóstico oportuno y rápido, motivo por el cual muchos síndromes febriles no palúdicos quedan sin diagnóstico etiológico claro. Objetivo. Establecer la etiología, describir las manifestaciones clínicas y explorar algunos posibles factores de riesgo relacionados con los síndromes febriles agudos no palúdicos en pacientes procedentes de los municipios de Necoclí, Turbo y Apartadó. Materiales y métodos. Se tomaron muestras de suero en fase aguda y de convalecencia de 220 pacientes febriles negativos para malaria, provenientes de zonas rurales y urbanas de Necoclí, Turbo y Apartadó en los años 2007 y 2008. Se practicaron pruebas para diagnóstico de dengue (detección de anticuerpos IgM por ELISA), leptospirosis (detección de anticuerpos IgM e IgG por IFI), rickettsiosis (detección de anticuerpos IgG por IFI), hantavirus y arenavirus (detección de anticuerpos IgG por ELISA). Resultados. Se encontraron frecuencias de dengue, leptospirosis, rickettsiosis y arenavirus de 37,3 %, 14,1 %, 2,7 % y 0,5 %, respectivamente. Se presentaron 12 casos de coinfección de leptospirosis-dengue y uno de leptospirosis-rickettsiosis-dengue. El sexo masculino y la humedad relativa media, fueron factores de riesgo para dengue. El inicio de signos clínicos en febrero de 2008, se asoció tanto con la infección por dengue como por leptospirosis. Conclusión. Se reafirma la importancia del virus del dengue, Rickettsia spp. y Leptospira spp., como agentes causantes del síndrome febril en la región del Urabá.


Introduction: Urabá, a region on the northern coast of Colombia, is endemic to several acute febrile illnesses of infectious origin; however, only patients with malaria may have access to quick and effective diagnosis. For this reason, many non-malarial febrile patients go without a clear etiologic diagnosis. Aim: To establish the etiology and clinical signs of acute febrile non-malaria syndromes and explore some of the likely risk factors in patients originating in the municipalities of Necocli, Turbo and Apartado who exhibit these symptoms. Materials and methods: We obtained acute and convalescent sera from 220 non-malarial febrile patients from the rural and urban zones of Necocli, Turbo and Apartado during 2007 and 2008. Serologic tests for dengue (IgM by ELISA), leptospirosis (IgM and IgG by IFA), rickettsiosis (IgG by IFI), hanta and arenavirus (IgG by ELISA) were performed. Results: We found that the frequency of infection for dengue, leptospirosis, rickettsiosis and arenavirus, was 37.3%; 14.1%; 2.7% and 0.5%, respectively. There were 12 co-infection cases of leptospirosis-dengue and one of leptospirosis-rickettsiosis-dengue. Male gender and relative humidity were considered risk factors for dengue, and the beginning of clinical signs in February of 2008 was associated with the infection of dengue and leptospirosis. Conclusion: This study confirms previous records that underline the importance of Rickettsia spp, dengue virus and Leptospira spp as causal agents of febrile syndrome in this region of Colombia.


Subject(s)
Adolescent , Adult , Aged , Child , Child, Preschool , Female , Humans , Male , Middle Aged , Arenaviridae Infections/epidemiology , Dengue/epidemiology , Fever of Unknown Origin/etiology , Leptospirosis/epidemiology , Rickettsia Infections/epidemiology , Acute Disease , Antibodies, Bacterial/blood , Antibodies, Viral/blood , Arenaviridae Infections/blood , Arenaviridae Infections/complications , Colombia , Convalescence , Dengue/blood , Dengue/complications , Hantavirus Infections/complications , Hantavirus Infections/epidemiology , Immunoglobulin G/blood , Immunoglobulin M/blood , Leptospirosis/blood , Leptospirosis/complications , Prevalence , Retrospective Studies , Rural Population , Rickettsia Infections/blood , Rickettsia Infections/complications , Seroepidemiologic Studies , Symptom Assessment , Urban Population
16.
Rev. colomb. cienc. pecu ; 23(4): 462-470, oct.-dic. 2010. graf, mapas, tab
Article in English | LILACS | ID: lil-636066

ABSTRACT

West Nile Virus (WNV) is an arthropod-borne agent classified in the Flavivirus genus. Infection has been demonstrated in many vertebrate species including birds, mammals and reptiles. WNV can affect the nervous system of humans, horses and birds causing mild to severe illness and sometimes death. In 1999 WNV was introduced into the Americas causing a small outbreak in New York City. In the following years, the virus spread across North America and later into Central America, the Caribbean and parts of South America. Serological evidence of WNV in Colombia was first documented in 2005 in equines from the Atlantic coast; however clinical cases in humans or animals have not been reported. We extended these studies searching for WNV antibodies in sera of equines of two other provinces in Colombia: Antioquia and El Meta. IgG and IgM antibodies were first determined and reactive sera were processed by plaque reduction neutralization test (PRNT) to confirm the specificity of results. Four horses from Antioquia but none from El Meta tested positive for WNV antibodies. These results suggest that WNV has spread across the Atlantic coast and is now invading the Andean region in Colombia.


El virus del Oeste del Nilo (WNV) es un agente del género Flavivirus transmitido por artrópodos. La infección con WNV ha sido demostrada en muchas especies de aves, mamíferos y reptiles. El WNV puede afectar el sistema nervioso de humanos, caballos y aves causando enfermedad de leve a severa, ocasionando la muerte en algunos casos. En 1999, el virus fue introducido en Norteamérica causando un brote en la ciudad de New York. En los siguientes años, el virus se extendió por Norteamérica, y posteriormente fue encontrado en el Caribe, Centro y Suramérica. El primer reporte de anticuerpos para WNV en Colombia se hizo en 2005, en equinos de la costa Atlántica. En el presente estudio se extendió la búsqueda de anticuerpos a otros dos Departamentos de Colombia: Antioquia y El Meta. Primero se determinó la presencia de anticuerpos IgM e IgG, y los sueros reactivos fueron procesados para anticuerpos neutralizantes por la técnica de reduccion de placas para confirmar los resultados. Cuatro equinos de Antioquia y ninguno de El Meta fueron positivos para anticuerpos anti-WNV. Los resultados sugieren que el WNV está ampliamente distribuido en la costa Atlántica de Colombia y ha iniciado su dispersión por la zona andina.


O vírus do Nilo Ocidental é um agente transmitido por artrópodes e pertence ao género Flavivirus. A infecção tem sido demonstrada em várias espécies de vertebrados incluindo pássaros, mamíferos e répteis. O vírus do Nilo Ocidental pode afectar o sistema nervoso de humanos, eqüinos e pássaros, causando doença de severidade média à grave a qual pode causar a morte em alguns casos. Em 1999, o vírus do Nilo Ocidental foi introduzido no continente americano, causando um surto na cidade de Nova York. Posteriormente, o vírus se disseminou pela América do Norte e mais tarde pela América Central, Caribe e parte da América do Sul. Os primeiros relatos do vírus do Nilo Ocidental na Colômbia surgiram em 2005 afectando eqüinos na costa atlântica. O objectivo desse trabalho foi buscar anticorpos contra o vírus do Nilo Ocidental no soro de equinos de dois estados da Colômbia: Antioquia e Meta. Anticorpos da classe IgG e IgM foram primeiramente determinados e soros reactivos foram analisados pela técnica de neutralização por redução em placa (PRNT) para confirmar a especificidade dos resultados. Quatro equinos provindos da Antioquia apresentaram resultados positivos para anticorpos contra o vírus do Nilo Ocidental; entretanto não foram detectados anticorpos nos animas provindos do Meta. Estes resultados sugerem que o vírus do Nilo Ocidental tem se disseminado através da costa atlântica e está agora invadindo a região andina na Colômbia.

17.
Infectio ; 14(4): 248-256, oct.-dic. 2010. graf, tab
Article in Spanish | LILACS, COLNAL | ID: lil-635650

ABSTRACT

Objetivo. Caracterizar el fenómeno de la resistencia a los diferentes medicamentos antirretrovirales en pacientes en quienes se practicó el estudio de genotipificación en Colombia, durante el período 2000-2007. Diseño. Descriptivo, retrospectivo y basado en el laboratorio. Métodos. Entre los años 2000 y 2007, se obtuvo la secuencia de los genes de la proteasa y transcriptasa inversa del virus de la inmunodeficiencia humana (VIH) de 650 pacientes presuntamente en tratamiento antirretroviral, procedentes de diferentes regiones de Colombia. Las secuencias se procesaron con el programa Geno2pheno resistance, el cual infiere la resistencia a partir de la secuencia. Resultados. El 82,1% de las cepas virales fue resistente a uno o más medicamentos. La frecuencia de resistencia fue mayor para la lamivudina (55,4%), la nevirapina (54,3%) y el efavirenz (52,6%), y más baja para la estavudina (11,0%). El 45,1% fue resistente a la zidovudina. La resistencia a los inhibidores de proteasa osciló entre 30% y 38%. Se observó que la frecuencia de resistencia va en aumento para los inhibidores de la transcriptasa inversa, pero no para los inhibidores de proteasa. Conclusiones. La frecuencia de resistencia fue mayor en los antirretrovirales con una baja barrera genética y en aquéllos cuyo uso se ha incrementado en los últimos años.


Objective. To characterize the resistance to anti-retroviral drugs in patients subject of genotypic sensitivity testing in Colombia during 2000-2007. Design. Descriptive, retrospective, laboratory based. Methods. Between the years 2000 and 2007 the sequences of the HIV protease and transcriptase genes were obtained from 650 patients presumably under antiretroviral treatment throughout the country. The sequences were processed with the program "geno2pheno resistance", which infers the resistance by using the sequences. The results were statistically analyzed. Results. 82.1% of the viral strains were resistant to one or more drugs. The frequency of resistance was higher for lamivudine (55.4%), nevirapine (54.3%), and efavirenz (52.6%), and lower for stavudine (11.0%). 45.1% were resistant to zidovudine. Resistance to protease inhibitors varied between 30% and 38%. We observed that the frequency of resistance is rising for the reverse transcriptase inhibitors but not for the protease inhibitors. Conclusions. The frequency of resistance was higher for the antiretroviral drugs with a lower genetic barrier and for those which use has increased during these last years.


Subject(s)
Humans , Drug Resistance , Acquired Immunodeficiency Syndrome , HIV , Antiretroviral Therapy, Highly Active , Colombia , Genetic Phenomena , Mutation
18.
Iatreia ; 17(3): 281-282, sept. 2004.
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-406171

ABSTRACT

Después de varias décadas de erradicación, el dengue se ha hecho endémico en la mayor parte de la América tropical y presenta tendencia al crecimiento en la mayoría de los países. La enfermedad ha sufrido un cambio en su expresión clínica en las últimas dos décadas. Una forma grave inexistente hasta los años 80 conocida como fiebre hemorrágica dengue (FHD) se ha diseminado primero por las Antillas, luego en Suramérica y más tarde en Centroamérica y Méjico, convirtiéndose en un problema significativo para la salud pública del continente. Las causas del aumento en la virulencia de la enfermedad producida por el virus del dengue (DENV) solo se conocen parcialmente. La potenciación de la enfermedad por acción de la inmunidad previa a serotipos diferentes al causante de la infección actual fue demostrada en el sureste asiático, pero no ha sido muy estudiada en las Américas. Además, este mecanismo no provee una explicación completa, puesto que FHD se ha observado también en personas que se infectan por primera vez, y la infección secundaria no siempre resulta en un cuadro severo...


Subject(s)
Molecular Epidemiology , Dengue
19.
Infectio ; 7(4): 204-213, dic. 2003. ilus, tab
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-422705

ABSTRACT

El uso generalizado de los medicamentos antirretrovirales y el gran número disponible de los mismos, ha abierto una esperanza de sobrevida para los pacientes infectados por el VHI, pero en la misma medida está aumentado el problema de resistencia a estos medicamentos. Actualmente se cuenta con diferentes técnicas que permiten detectar esta resistencia a través de pruebas de susceptibilidad a los antivirales: pruebas genotípicas y fenotípicas. En esta corta revisión se muestran sus fundamentos y las indicaciones de las mismas


Subject(s)
HIV , Anti-Retroviral Agents , Drug Resistance, Viral/genetics , Microbial Sensitivity Tests
20.
Infectio ; 5(2): 87-95, jun. 2001. ilus, tab
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-434508

ABSTRACT

Introducción: la exposición repetida al virus de la inmunodeficiencia humana (VIH) no siempre llevan la infección, multiples factores de resistencia han sido propuestos, pero sólo una mutación, la delección de 32 pares de base (delta 32)en el gen que codifica por la molécula CCR5, confiere un alto grado de protección; esta molécula es el principal correceptor del virus: Objetivos: determinar la frecuencia de delta 32 en Medellín, Colombia y buscar otros polimorfismos en el gen ccr5 en individuos expuestos al VIH y seronegativos (ESNs). Materiales y métodos: la mutación delta 32 se determinó por la técnica de reacción en cadena de la polimerasa en 218 individuos: 29 seropositivos (SP), 39 ESN y 150 individuos de la población general (PG). Por medio de la técnica de polimorfismos conformacionales de cadena simple (SSCP) se buscaron otras mutaciones en el gen ccr5 en la población de ESNs. Resultados: la frecuencia del alelo delta 32 fué de 3.8 por ciento para ESN, 2.7 por ciento para PG y 1.7 por ciento para SP. Entre los ESNs se encontró el único genotipo homocigótico mutado (ccr5/ delta 32/delta 32), se encontro en el 5.3 por ciento de la PG y en 2.6 por ciento de SP y de ESNs. Las diferencias en las frecuencias alélicas y genotipicas entre los grupos no fueron estadísticamente significativas. La comparación entre las frecuencias genotípicas esperadas y observadas mostró que estas frecuencias eran significativamente diferentes en el grupo de ESNs. Lo que sugirió en forma indirecta, un efecto protector del geneotipo gemocigótico mutado en delta 32/delta 32. No se encontró ninguna otra mutación en el gen ccr5. Conclusión: la baja frecuencia del genotipo homocigótico mutado delta 32/delta 32y la ausencia de otras mutaciones en ccr5 en los ESNs sugierén la presencia de otros mecanismos de resitencia a la infección por VIH en nuestra población


Subject(s)
HIV Infections , Mutation , HIV Seronegativity
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